[DNA条形码技术的概况及其在大型海藻中的应用]DNA条形码技术

　　摘 要:随着DNA条形码技术的不断发展,资源丰富的条形码序列信息可供研究者进行各个物种的研究工作,藻类分类学家也做了各种各样的尝试,开发有效的DNA条形码序列进行相关藻种的鉴定,目前的条形码如RBCL、ITS均在石莼属等物种鉴定工作中取得了一定的效果。

　　关键词:DNA条形码 海藻 鉴定 绿潮

　　中图分类号:Q19 文献标识码:A 文章编号:1672-3791(2012)06(c)-0247-01

　　1 DNA条形码的发展

　　由于形态学鉴定所固有的这些缺点,使得物种多样性的鉴定遇到了技术上的瓶颈,人们开始尝试着寻找一种更为科学的鉴定方法,DNA条形码技术成为了一种令人振奋的技术手段。目前这种技术手段已经广泛的应用到了一些形态差异较小的种群之中,如细菌、病毒、原生动物等[1]。

　　在动物中,线粒体基因组相对于核基因组而言已经成为了更为关注的研究对象,是分子分类学家寻找DNA条形码的重点。这主要是由于它在基因中缺少内含子的区域,重组中受限制和单倍体遗传模式等特点[2]。早一些的研究主要集中在线粒体中编码核糖体(12S 16S)的基因中。但是这些基因的广泛应用受到了一定的限制,其限制主要来自月自身的碱基插入突变或移码突变,由于突变而使比对的复杂性增加。理论上任何基因都没有强制优先作为条形码的理由,但是COI的出现后其对于其他的线粒体基因的确有着无法比拟的优势。与其他编码蛋白的基因一样,其密码子的第三位碱基有一定的简并性,使它的分子水平的进化率高于如12S或16S等一般线粒体基因3倍之多,事实上,此基因的进化水平不但可以分辨种间的物种,甚至可以分辨种内的不同个体。虽然也会有其它的基因能够与它的进化速度相当 ……此处隐藏1918个字…… 9 Nucleotide Substitution Rate of Mammalian Mitochondrial Genomes J.MOLECULAR EVOLUTION Volume 48,Number4,427～434.

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　　[6] 汪文俊,王飞久,陈松,等.浒苔ITS区的扩增和分析[J].海洋水产研究,2008,29(5):520～921.